प्रबंध परिषद अपने प्रशासनिक समर्थन/सहयोग द्वारा प्रयोगशाला की दैनिक कार्यप्रणाली को सुचारू रूप से चलाने में मुख्य भूमिका निभाती है।

सीएसआईआर के पत्र सं. 8(1)/2011-पीडी दि. 03-01-2012, के अनुसार सीएसआईआर नियमावली के नियम 65 के अंतर्गत प्रबंध परिषद के पुनर्गठन के विदेशों में निम्नानुसार संशोधन किया गया हैः-

(i) राष्ट्रीय प्रयोगशाला के निदेशक – अध्यक्ष

(ii) विभिन्न आयु समुद्र के प्रतिनिधि चार वैज्ञानिक

1) दो वैज्ञानिक – (पीबी 3) (एक वैज्ञानिक/एक वरिष्ठ वैज्ञानिक तथा

2) दो वैज्ञानिक – (पीबी 4) (एक प्रधान वैज्ञानिक तथा एक व.प्र.वैज्ञानिक अथवा मुख्य वैज्ञानिक)

इस वर्ग के अंतर्गत नामित सभी वैज्ञानिकों का पीएचडी अथवा एमटेक होना आवश्यक तथा वे निरंतर दो प्रबंध परिषद के सदस्य नहीं प्रयोगशाला के निदेशक के प्रभाग से केवल अधिकतम एक वैज्ञानिक को ही प्रबंध परिषद का सदस्य रखा जा सकता है। यदि प्रयोगशाला में प्रतिष्ठित वैज्ञानिक/ वैज्ञानिक-एच हैं तो वे परिषद की बैठकों में विशेष आमंत्रित होगेः-

iii) तकनीकी कार्मिकों में से एक प्रतिनिधि – प्रयोगशाला में पी-बी-4 में कार्यरत तकनीकी अधिकारी, यदि हों अथवा वरिष्ठतम तकनीकी अधिकारी

iv) उसी प्रयोगशाला अथवा सहयोगी प्रयोगशाला से एक निदेशक श्रेणी वैज्ञानिक – समान क्लस्टर अथवा शहर/राज्य की सहयोगी प्रयोगशाला के निदेशक

v)  प्रयोगशाला के अनुसंधान योजना व्यवसाय विकास/योजना मानिटरन तथा मूल्यांकन के प्रमुख – प्रभाग प्रमुख तथा यदि इस वर्ग में एक से अधिक प्रभाग हों तो इन प्रभागों में से वरिष्ठतम प्रमुख

vi)  प्रयोगशाला के वित्त एवं लेखा नियंत्रक/वित्त एवं लेखा अधिकारी – प्रयोगशाला के वरिष्ठतम वित्त एवं लेखा अधिकारी

vii) प्रयोगशाला प्रशासन नियंत्रक/प्रशासन अधिकारी सदस्य सचिव होंगे

संस्थान के निदेशक की अनुपस्थिति में, कार्यकारी निदेशक प्रबंध परिषद के अध्यक्ष होंगे तथा परिषद् की बैठक की अध्यक्षता करेंगे एवं कार्यवाही को अनुमोदन भी देंगे. परिषद् की बैठक प्रत्येक वित्तीय वर्ष में कम से कम तीन बार अवश्य होनी चाहिए. तदनुसार सीईसीआरआई की प्रबंध परिषद् का पुनर्गठन CECRI OM No.2/26/COA/2012, दिनांक 02-04-2012 के द्वारा किया गया तथा इसके अनुसार परिषद् के सदस्य निम्नानुसार हैं : 

सदस्य 

• प्रयोगशाला के मामलों एवं पर्यावरण का प्रशासन एवं प्रबंधन .
• सीएसआईआर द्वारा निर्धारित सीमा के अंदर वापिस न मिल सकने वाले आर्थिक नुकसान तथा सामग्री को बट्टेखाते में डालना .
• अनुसंधान एवं विकास कार्यों/प्रयोगशाला/संस्थान की सुविधाओं के लिए स्रोत निर्धारण हेतु संस्तुति .
• अनुसंधान एवं विकास कार्यों तथा अन्य कार्यों की प्रगति का मॉनिटरन.
• To recommend devolution of powers to the Project Leaders for the proper implementation of the projects/activities.
• To approve contract R&D, consultancy projects and licensing of IPR beyond the powers of Director.
• To consider the annual report of the National Laboratory.
• To constitute selection Committees and assessment committees for all Technical staff.
• Any other matter, as may be referred by the Director-General.
• The proceedings of the Management Council shall be approved by its Chairman.  The Governing Body or Director-General as its Principal Executive Officer may review/amend any of the decisions of the Management Council, and pass such orders as considered necessary, which shall be binding on the Management Council.